ＹＡＨＯＯメール（ＷＥＢメール）のメールはＹＡＨＯＯのメールサーバー上にメッセージが保存されているので、パソコンのＨＤＤには何も保存されていません。その意味でパソコン環境に影響はありません。

　一方ＡＵＯＮＥメール（ＰＯＰメール）はＡＵＯＮＥ　ＮＥＴのメールサーバーにメールが届きますが、メーラーでメールチェックをするとサーバーからパソコンのＨＤＤへメッセージがダウンロードされます。
この時、メーラーのアカウントの設定で「サーバーにメッセージのコピーを置く」というチェックボックスを空白（つまりＯＦＦ）にしてあれば（デフォルトはＯＦＦ）、メールチェックしてメッセージをダウンロード後にメールサーバーからメッセージを削除してくれます。

　よって、通常のＰＯＰメールでは、メールサーバーはメールチェック後は空っぽの状態です。
　ダウンロードしたメッセージはパソコンのＨＤＤ内にあるメールメッセージ用のフォルダに保存されますので、パソコンのＨＤＤを圧迫しますが、圧迫といっても今時のパソコンは５００ＧＢなど、大容量のＨＤＤを内臓しているので、添付ファイルが４ＭＢ等であっても、ＨＤＤを圧迫するという程の問題ではない。

　もちろん不要な添付ファイルや画像、動画などをパソコンに残しておくのは意味がないので削除すればいい。
　添付ファイルは必要だからメールで送ってくるのでしょうから、パソコンに保存するといいのではないですか？
　Ｙａｈｏｏメールのメールサーバーも有限なので、必要な添付ファイルなどはパソコンへ保存するのがいいと思います。

　またクラウド上（サーバー上）に重要なデータや個人情報を含むデータを保存しておく場合にはセキュリティに充分気をつけないと、他人に見られたり、下手をすると何万人の個人情報がサーバーから漏洩したなどということにもなりかねません。
　パソコンはパソコンでウイルス対策やファイヤーウオールをしっかり行なっていないと、パソコンから大事な情報を盗み取られるという事もあり得ます。

WEBメールサーバーの容量が２Gまでとのお話ですね。
容量を知りたかったのです。
有難うございました。
とにかく　必要ないメールは削除すべきという事ですね。